Kokcydia występujące u psów i kotów w zależności od rodzaju należą do jednej z trzech rodzin Eimeriidae, Cryptosporidiidae lub Sarcocystidae. Niektóre kokcydia, takie jak Cryptospridium, są pasożytami monoksenicznymi wykorzystującymi w cyklu życiowym tylko jednego żywiciela, ale u innych heteroksenicznych kokcydiów rozmnażanie bezpłciowe i płciowe występuje u różnych żywicieli. Patogenność zależy od gatunku, a przebieg choroby może być zróżnicowany – od bezobjawowego do ostrego. Cystoisospora jest najczęściej występującym rodzajem, który jest również specyficzny dla żywiciela, dlatego ryzyko dla zdrowia ludzkiego ze strony tych pasożytów uważa się za minimalne lub nieistniejące, nawet u ludzi z obniżoną odpornością.