Niektóre badania kału można z łatwością zastosować w diagnostyce różnicowej takich schorzeń, jak infekcje przewodu pokarmowego, zespoły złego wchłaniania i enteropatie jelit. Ogólne analizy kału obejmują: badanie makroskopowe i mikroskopowe, badania chemiczne (pH, enzymy trzustkowe, kalprotektyna), badania immunologiczne i mikrobiologiczne. Kał należy również sprawdzić makroskopowo pod kątem: koloru, konsystencji, ilości, kształtu, zapachu i śluzu. Badanie mikroskopowe pozwala wykryć obecność: leukocytów, włókien mięśniowych, skrobi, elementów roślinnych, pasożytów, zaburzeń mikroflory jelitowej. Ponadto dodatkowe badania mogą wykryć krew utajoną, tłuszcze, cukry (substancje redukujące) oraz przyczyny zakaźne i inwazyjne zapaleń jelit.